Glitch เปิดฉากเล่าเรื่องผ่าน ฮงจีฮโย (รับบทโดย จอนยอบิน) หญิงสาวที่ใช้ชีวิตเฉกเช่นมนุษย์ชนชั้นกลางทั่วไป เธอทำงานในบริษัทออกแบบครบวงจรด้วยความสามารถที่โดดเด่น มีเงินทองจับจ่ายใช้สอยอย่างไม่ขัดสน ทั้งยังมีคนรักที่คบกันยาวนานกว่าสี่ปีและมีท่าทีว่าจะย้ายเข้าไปอยู่ด้วยกันในเร็ววัน แต่ถึงกระนั้นฮงจีฮโยกลับขาดความสุขเพราะมีบางอย่างคอยจู่โจมอยู่เป็นระยะ วันดีคืนดีเธอมองเห็นสิ่งมีชีวิตคล้ายมนุษย์ต่างดาวด้วยตาเปล่า ข้าวของเครื่องใช้ถูกคลื่นแม่เหล็กรบกวนจนพังเสียหาย ซ้ำร้ายแฟนหนุ่มของเธอยังหายตัวไปอย่างลึกลับ ฮงจีฮโยติดตามเบาะแสจนพบกับสัญลักษณ์ประหลาดจึงเชื่อว่าคนรักถูกมนุษย์ต่างดาวลักพาตัว เธอเริ่มค้นหาข้อมูลตามด้วยการขอความช่วยเหลือจากชมรมศึกษายูเอฟโอและสิ่งลึกลับในจักรวาล ณ ที่แห่งนั้นฮงจีฮโยได้พบผู้คนที่มีความสนใจเรื่องเดียวกันรวมทั้ง ฮอโบรา (รับบทโดย นานะ) หญิงสาวบุคลิกเก๋ไก๋ผู้เคยเป็นเพื่อนสนิทในอดีต ทั้งหมดจึงร่วมมือกันคลำทางไขปริศนาจนนำพาไปสู่การเผชิญหน้ากับองค์กรลึกลับอันน่าสะพรึงกลัว ขณะเดียวกันฮงจีฮโยยังได้ปะติดปะต่อความทรงจำในอดีต ก่อนจะพบว่าตัวเธอเองมีส่วนเกี่ยวข้องกับสิ่งมีชีวิตนอกโลกมากกว่าที่ใครคาดคิด